Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1AP37088 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1AP37088 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1AP37088 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1AP37088 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1AP37088 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1AP37088 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1AP37088 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms