Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL9P32969 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL9P32969 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL9P32969 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL9P32969 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL9P32969 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL9P32969 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL9P32969 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL9P32969 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL9P32969 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL9P32969 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL9P32969 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL9P32969 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL9P32969 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL9P32969 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL9P32969 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL9P32969 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL9P32969 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL9P32969 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL9P32969 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL9P32969 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL9P32969 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL9P32969 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL9P32969 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL9P32969 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL9P32969 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL9P32969 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL9P32969 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL9P32969 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL9P32969 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL9P32969 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL9P32969 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL9P32969 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL9P32969 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL9P32969 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL9P32969 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL9P32969 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL9P32969 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL9P32969 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL9P32969 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL9P32969 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL9P32969 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL9P32969 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL9P32969 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL9P32969 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL9P32969 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL9P32969 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL9P32969 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL9P32969 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL9P32969 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL9P32969 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL9P32969 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPL9P32969 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL9P32969 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL9P32969 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL9P32969 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL9P32969 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL9P32969 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL9P32969 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL9P32969 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL9P32969 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL9P32969 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL9P32969 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL9P32969 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL9P32969 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL9P32969 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL9P32969 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL9P32969 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL9P32969 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL9P32969 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL9P32969 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL9P32969 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL9P32969 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL9P32969 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL9P32969 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL9P32969 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL9P32969 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL9P32969 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL9P32969 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL9P32969 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms