Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHATP28329 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHATP28329 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHATP28329 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHATP28329 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHATP28329 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHATP28329 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHATP28329 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHATP28329 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHATP28329 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHATP28329 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHATP28329 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHATP28329 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHATP28329 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHATP28329 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHATP28329 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHATP28329 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHATP28329 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHATP28329 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHATP28329 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHATP28329 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHATP28329 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHATP28329 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHATP28329 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHATP28329 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHATP28329 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHATP28329 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHATP28329 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHATP28329 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHATP28329 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHATP28329 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHATP28329 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHATP28329 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHATP28329 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHATP28329 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHATP28329 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHATP28329 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHATP28329 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHATP28329 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHATP28329 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHATP28329 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms