Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VIL1P09327 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIL1P09327 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIL1P09327 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIL1P09327 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIL1P09327 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIL1P09327 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIL1P09327 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIL1P09327 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIL1P09327 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIL1P09327 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VIL1P09327 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VIL1P09327 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VIL1P09327 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VIL1P09327 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VIL1P09327 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VIL1P09327 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VIL1P09327 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VIL1P09327 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VIL1P09327 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VIL1P09327 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VIL1P09327 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VIL1P09327 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VIL1P09327 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VIL1P09327 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VIL1P09327 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VIL1P09327 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VIL1P09327 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VIL1P09327 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VIL1P09327 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VIL1P09327 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VIL1P09327 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VIL1P09327 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VIL1P09327 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIL1P09327 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIL1P09327 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIL1P09327 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIL1P09327 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIL1P09327 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIL1P09327 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIL1P09327 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIL1P09327 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIL1P09327 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIL1P09327 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIL1P09327 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIL1P09327 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIL1P09327 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIL1P09327 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIL1P09327 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VIL1P09327 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VIL1P09327 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VIL1P09327 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VIL1P09327 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VIL1P09327 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VIL1P09327 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VIL1P09327 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VIL1P09327 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VIL1P09327 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VIL1P09327 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VIL1P09327 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VIL1P09327 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VIL1P09327 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VIL1P09327 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VIL1P09327 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VIL1P09327 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VIL1P09327 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VIL1P09327 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VIL1P09327 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VIL1P09327 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VIL1P09327 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VIL1P09327 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIL1P09327 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms