Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCL10P02778 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL10P02778 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms