Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFDP00746 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFDP00746 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFDP00746 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFDP00746 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFDP00746 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFDP00746 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFDP00746 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFDP00746 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFDP00746 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFDP00746 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFDP00746 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFDP00746 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFDP00746 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFDP00746 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CFDP00746 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFDP00746 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFDP00746 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFDP00746 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFDP00746 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFDP00746 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFDP00746 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFDP00746 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFDP00746 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFDP00746 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFDP00746 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CFDP00746 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFDP00746 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CFDP00746 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms