Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN11O75508 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN11O75508 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms