Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TIMM17BO60830 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TIMM17BO60830 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms