Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP9O43818 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP9O43818 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP9O43818 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP9O43818 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP9O43818 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP9O43818 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP9O43818 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP9O43818 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP9O43818 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP9O43818 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP9O43818 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP9O43818 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP9O43818 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP9O43818 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP9O43818 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP9O43818 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP9O43818 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP9O43818 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP9O43818 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP9O43818 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP9O43818 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP9O43818 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP9O43818 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRP9O43818 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRP9O43818 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRP9O43818 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRP9O43818 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRP9O43818 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRP9O43818 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRP9O43818 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RRP9O43818 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RRP9O43818 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRP9O43818 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRP9O43818 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRP9O43818 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRP9O43818 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRP9O43818 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRP9O43818 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RRP9O43818 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRP9O43818 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRP9O43818 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRP9O43818 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRP9O43818 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP9O43818 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP9O43818 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP9O43818 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP9O43818 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP9O43818 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP9O43818 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP9O43818 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRP9O43818 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP9O43818 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP9O43818 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP9O43818 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP9O43818 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP9O43818 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP9O43818 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP9O43818 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRP9O43818 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP9O43818 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP9O43818 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP9O43818 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP9O43818 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP9O43818 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP9O43818 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP9O43818 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP9O43818 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP9O43818 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP9O43818 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP9O43818 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP9O43818 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRP9O43818 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP9O43818 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP9O43818 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP9O43818 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP9O43818 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP9O43818 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP9O43818 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP9O43818 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRP9O43818 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms