Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms