Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GNPATO15228 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GNPATO15228 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GNPATO15228 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GNPATO15228 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GNPATO15228 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPATO15228 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPATO15228 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPATO15228 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPATO15228 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPATO15228 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPATO15228 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPATO15228 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPATO15228 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPATO15228 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPATO15228 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPATO15228 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPATO15228 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GNPATO15228 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GNPATO15228 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GNPATO15228 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GNPATO15228 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GNPATO15228 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GNPATO15228 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GNPATO15228 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPATO15228 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPATO15228 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPATO15228 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPATO15228 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPATO15228 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPATO15228 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPATO15228 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPATO15228 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPATO15228 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPATO15228 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPATO15228 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPATO15228 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPATO15228 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPATO15228 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPATO15228 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPATO15228 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPATO15228 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPATO15228 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPATO15228 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPATO15228 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPATO15228 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GNPATO15228 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GNPATO15228 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GNPATO15228 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GNPATO15228 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GNPATO15228 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GNPATO15228 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GNPATO15228 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GNPATO15228 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GNPATO15228 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GNPATO15228 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GNPATO15228 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GNPATO15228 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GNPATO15228 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNPATO15228 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNPATO15228 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNPATO15228 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNPATO15228 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNPATO15228 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNPATO15228 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GNPATO15228 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNPATO15228 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNPATO15228 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNPATO15228 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNPATO15228 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNPATO15228 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNPATO15228 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNPATO15228 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GNPATO15228 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNPATO15228 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNPATO15228 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNPATO15228 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNPATO15228 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNPATO15228 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNPATO15228 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNPATO15228 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GNPATO15228 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPATO15228 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPATO15228 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPATO15228 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPATO15228 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPATO15228 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPATO15228 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPATO15228 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPATO15228 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPATO15228 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPATO15228 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPATO15228 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPATO15228 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPATO15228 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNPATO15228 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNPATO15228 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNPATO15228 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNPATO15228 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNPATO15228 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms