Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.1 ms