Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1LA6NFU8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms