Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X4

FAM169A, Soluble lamin-associated protein of 75 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM169AQ9Y6X4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM169AQ9Y6X4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM169AQ9Y6X4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms