Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms