Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms