Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms