Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJD2Q9UKL4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms