Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms