Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL13Q9P2N7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms