Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRMT1Q9NXH9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT1Q9NXH9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms