Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 PRMT5-205ENST00000421938 565 ntTSL 322.1■■□□□ 1.135e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 DNPEP-204ENST00000373966 1875 ntTSL 521.96■■□□□ 1.115e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 DHCR7-206ENST00000527316 1005 ntTSL 521.63■■□□□ 1.055e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PRMT5-210ENST00000553550 580 ntTSL 321.56■■□□□ 1.045e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ST6GALNAC6-212ENST00000485320 2357 ntTSL 521■□□□□ 0.955e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PRMT5-215ENST00000554716 561 ntTSL 420.87■□□□□ 0.935e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ST6GALNAC6-208ENST00000478319 452 ntTSL 520.72■□□□□ 0.915e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 VARS-224ENST00000479051 612 ntTSL 320.7■□□□□ 0.95e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.865e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.815e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 CDK5RAP2-214ENST00000481266 970 ntTSL 520.05■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PRMT5-216ENST00000554867 555 ntTSL 219.99■□□□□ 0.795e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.775e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 DNPEP-203ENST00000373963 1657 ntTSL 519.8■□□□□ 0.765e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PRMT5-212ENST00000553787 579 ntTSL 419.71■□□□□ 0.755e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 SDF4-205ENST00000465727 2095 ntTSL 219.59■□□□□ 0.735e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.725e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.715e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 DNPEP-218ENST00000521459 714 ntTSL 519.25■□□□□ 0.675e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.666e-11■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 AVL9-207ENST00000485228 489 ntTSL 518.91■□□□□ 0.626e-11■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 EPC2-205ENST00000457184 724 ntTSL 518.76■□□□□ 0.595e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.575e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.575e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.565e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 CHERP-204ENST00000546538 1429 ntTSL 1 (best)18.56■□□□□ 0.565e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.565e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 GIT2-211ENST00000548643 936 ntTSL 218.53■□□□□ 0.566e-11■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 MMS19-211ENST00000441194 916 ntTSL 518.5■□□□□ 0.555e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 MMS19-210ENST00000439048 609 ntTSL 518.42■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.525e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PRPF31-205ENST00000445811 928 ntTSL 518.28■□□□□ 0.525e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 METTL22-201ENST00000163678 1510 ntTSL 1 (best)18.24■□□□□ 0.515e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.55e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.485e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.475e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 DNPEP-206ENST00000429013 896 ntTSL 517.95■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.455e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 MMS19-205ENST00000422685 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.71■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 MMS19-208ENST00000437002 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.71■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.395e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.395e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.32■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 LAD1-206ENST00000631576 550 ntTSL 417.32■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 METTL22-216ENST00000568967 1672 ntTSL 217.32■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 DHCR7-205ENST00000526780 968 ntTSL 217.3■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 SLC25A30-203ENST00000519547 582 ntTSL 417.28■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 THBS1-202ENST00000397591 582 ntTSL 217.27■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 GIT2-217ENST00000551455 2014 ntTSL 217.23■□□□□ 0.356e-11■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.13■□□□□ 0.335e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PPFIBP2-223ENST00000532926 1597 ntTSL 217.11■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.326e-11■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.35e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 MMS19-213ENST00000448660 776 ntTSL 516.92■□□□□ 0.35e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.295e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.275e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 HLA-A-208ENST00000496081 1786 nt16.72■□□□□ 0.275e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.255e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ZNF251-202ENST00000524394 315 ntTSL 516.61■□□□□ 0.255e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.255e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.245e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 TACO1-202ENST00000581120 2304 ntTSL 216.52■□□□□ 0.235e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.236e-11■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 DAGLA-202ENST00000540717 5699 ntTSL 516.37■□□□□ 0.215e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.215e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PRPF31-206ENST00000447810 854 ntTSL 516.33■□□□□ 0.25e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PRPF31-204ENST00000445124 886 ntTSL 516.33■□□□□ 0.25e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 TOMM40L-203ENST00000465512 669 ntTSL 216.03■□□□□ 0.165e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.145e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.135e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.135e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.126e-11■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 AVL9-204ENST00000459629 7937 ntTSL 215.69■□□□□ 0.16e-11■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ST6GALNAC6-210ENST00000481355 466 ntTSL 315.63■□□□□ 0.095e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.095e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 SLC25A30-202ENST00000463262 426 ntTSL 315.47■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 LAD1-208ENST00000633953 589 ntAPPRIS P1 TSL 415.46■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ACOX2-208ENST00000474098 708 ntTSL 315.41■□□□□ 0.065e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ZNF251-203ENST00000525191 618 ntTSL 315.27■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.035e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ACOX2-213ENST00000492530 578 ntTSL 315.12■□□□□ 0.015e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ADCY6-208ENST00000552090 861 ntTSL 515.12■□□□□ 0.015e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.035e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.035e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.045e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 DGKD-203ENST00000427930 482 ntTSL 514.74□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.065e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 KMT2D-206ENST00000550356 445 ntTSL 314.59□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 TOMM40L-206ENST00000474486 2396 ntTSL 214.57□□□□□ -0.085e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 MOV10-214ENST00000490413 1370 ntTSL 214.57□□□□□ -0.085e-6■■■■■ 31.7
Retrieved 100 of 21,863 protein–RNA pairs in 137 ms