Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
INTS9Q9NV88 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms