Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms