Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6BQ9NRW1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms