Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTORQ9NRC9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms