Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms