Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms