Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELP3Q9H9T3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELP3Q9H9T3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELP3Q9H9T3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELP3Q9H9T3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELP3Q9H9T3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELP3Q9H9T3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELP3Q9H9T3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELP3Q9H9T3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELP3Q9H9T3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms