Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLVAPQ9BX97 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms