Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP8Q9BV40 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms