Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms