Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MGME1Q9BQP7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MGME1Q9BQP7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MGME1Q9BQP7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MGME1Q9BQP7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGME1Q9BQP7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms