Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RILPQ96NA2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RILPQ96NA2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RILPQ96NA2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RILPQ96NA2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RILPQ96NA2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RILPQ96NA2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RILPQ96NA2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RILPQ96NA2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RILPQ96NA2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RILPQ96NA2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RILPQ96NA2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RILPQ96NA2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RILPQ96NA2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RILPQ96NA2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RILPQ96NA2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RILPQ96NA2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RILPQ96NA2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RILPQ96NA2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RILPQ96NA2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RILPQ96NA2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RILPQ96NA2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RILPQ96NA2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms