Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms