Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM2Q96JY6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms