Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms