Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RNF183Q96D59 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RNF183Q96D59 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RNF183Q96D59 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF183Q96D59 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RNF183Q96D59 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RNF183Q96D59 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RNF183Q96D59 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RNF183Q96D59 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RNF183Q96D59 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RNF183Q96D59 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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