Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RCN3Q96D15 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms