Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms