Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCC1Q92922 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCC1Q92922 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCC1Q92922 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCC1Q92922 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCC1Q92922 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCC1Q92922 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms