Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms