Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms