Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPRYD3Q8NCJ5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPRYD3Q8NCJ5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SPRYD3Q8NCJ5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPRYD3Q8NCJ5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms