Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms