Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HACD2Q6Y1H2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD2Q6Y1H2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD2Q6Y1H2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD2Q6Y1H2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD2Q6Y1H2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD2Q6Y1H2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD2Q6Y1H2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms