Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms