Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP4Q6PIL6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms