Protein–RNA interactions for Protein: Q6AWC8

Putative uncharacterized protein LOC100129027, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6AWC8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6AWC8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6AWC8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6AWC8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6AWC8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6AWC8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6AWC8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6AWC8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6AWC8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6AWC8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6AWC8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6AWC8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6AWC8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6AWC8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6AWC8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6AWC8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6AWC8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6AWC8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6AWC8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6AWC8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6AWC8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6AWC8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q6AWC8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q6AWC8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q6AWC8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms