Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPECC1LQ69YQ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms